Dalla convenzione costitutiva della CN-ER derivano specifici accordi attuativi, allo scopo di concretizzare delle attività congiunte tra gli enti aderenti; ad esempio per l'adesione alle singole iniziative di PiTER, piuttosto che per l'adesione a progetti in risposta a bandi o avvisi nazionali e comunitari o ancora per la realizzazione di progetti ben definiti su temi particolari.
Anche i singoli territori provinciali hanno adottato questa modalità di portare avanti iniziative nell'ambito dei temi governati dalla convenzione, per la concretizzazione di attività specifiche con gli enti locali.
Uno dei primi accordi attuativi (fine 2007, con sottoscrizione nel 2008, subito dopo la sottoscrizione della CN-ER) ha determinato la partecipazione agli avvisi Ali e Riuso in modo congiunto da tutti gli Enti emiliano-romagnoli, prevedendo la definizione del Progetto del Sistema a rete regionale.
Strettamente legato al primo. A seguito dell'approvazione del progetto da parte di DigitPA (ex CNIPA), nel 2010 si è stati tutti chiamati alla sottoscrizione dell'Accordo Attuativo che prevedeva i trasferimenti dei fondi di co-finanziamento: lo hanno sottoscritto prima le 9 Province con i rispettivi Enti del loro territorio e di seguito la Regione Emilia Romagna con le 9 Province, in data 25/02/2011.
Fin da subito (2008) è stato realizzato l'Accordo che riguarda il consolidamento e lo sviluppo del sistema di e-learning federato (SELF), una rete costituita a partire dal 2005 dagli enti locali e dalla Regione Emilia-Romagna che la coordina, per promuovere, diffondere e sperimentare l'uso delle nuove tecnologie per la formazione di dipendenti pubblici, cittadini e imprese.
L'organizzazione pensata prevede al centro il Learning Point Master e un Comitato di Indirizzo e Coordinamento e, all'esterno nei vari territori, i Learning Point Locali. Il Learning Point Master è una struttura di servizio gestita da Regione e Lepida SpA che offre la piattaforma informatica, il catalogo dei corsi, i moduli in e-learning, i servizi e il know how.
A inizio 2009 è nato il cosiddetto Accordo Territorio e Fiscalità, con l'obiettivo di portare alla realizzazione di banche dati territoriali centralizzate, in una logica di gestione condivisa.
I contenuti dell'Accordo sono divisi in 4 ambiti distinti:
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